2010 - Parceiros de Visão
Concedido pela Fundação Dorina Nowill para Cegos
2010 – Amiga do Esporte
Concedido pelo Ministério dos Esportes
2009 – Maiores e Melhores do Transporte de 2008
Concedido pela Revista Transporte Moderno, OTM Editora
2009 – 100 + inovadoras em TI
Concedido pela Revista InformationWeek Brasil
2009 - As Melhores da Dinheiro – setor Serviços de Transporte 2008
Concedido pela Revista Isto é Dinheiro
2009 – ILOS de Logística – Segmento Metalurgia e Siderurgia
Concedido pelo Instituto de Logística Supply Chain
2008 - Prêmio Revista Ferroviária
Prêmio concedido pela Revista Ferroviária
2008 – Maiores & Melhores do Transporte e Logística – segmento transporte ferroviário de cargas
Prêmio concedido à MRS pela sexta vez pela OTM Editora (revista Transporte Moderno)
2008 - Operadora de Logística do Ano
Prêmio concedido pela Revista O Empreiteiro
2008 – As 100 + inovadoras em TI – serviços infra-estrutura, transporte e logística
Prêmio concedido pela edição brasileira da revista Information Week
2007 – As Melhores da Dinheiro – Melhor Operadora de Transporte
Prêmio concedido pela Revista IstoÉ Dinheiro
2007 - Melhor Operadora Ferroviária De Carga
Prêmio concedido pela revista ferroviária
(prêmio já recebido também em 2006, 2004, 2003, 2002, 2000)
2007 - Melhor Operadora Ferroviária de Carga
Prêmio concedido pelas revistas Transportes Moderno e Technibus
(prêmio já recebido também em 2005, 2004, 2002)
2007 - Melhores Setor Ferroviário
Prêmio concedido pela Revista Dinheiro
2007 - Certificação ISO 14001 e OHSAS 18001 (Projeto Piloto)
2006 - Certificação ISO 9001 - Carga Geral
2005 - Certificação ISO 9001 - Heavy Haul
2005 - Ferroviário do Ano: Julio Fontana Neto, Presidente da MRS Logística
2003 - Melhor Ferrovia do Brasil
Prêmio concedido pela Revista Trade and Transport
2003 - Destaque 2003, categoria Serviços Públicos
Conferido pelo Clube de Engenharia de Juiz de Fora
2002 - A Mais ligada de Minas Prêmio concedido pela Revista InfoExame
1999 - Melhor Operadora Ferroviária de Carga
Prêmio concedido pela Revista Global
